全外显子测序

    技术简介

全外显子测序（Whole Exome Sequencing，WES）是较常见的基因组测序方法，通过利用探针杂交富集外显子区域的DNA序列，进行高通量测序，来发现与蛋白质功能变异相关遗传突变的技术手段。外显子是人基因组的蛋白编码区域，虽仅占全基因组1%左右，但覆盖了85%的致病突变。通过测序所获取的数据，结合大量的公共数据库提供的外显子致病信息，有利于更好地解释所得变异与疾病的关系。相比于全基因组测序，外显子组测序更高深度、更加经济、高效。

    技术优势

l 直接对蛋白编码序列进行测序，拥有可靠的基因突变鉴定方案和权威的突变鉴定软件，找出影响蛋白结构的变异

l 高捕获效率，高深度测序，可发现变异频率低于1%的罕见变异

l 仅针对外显子组区域，有效降低测序费用、存储空间和工作

    技术流程

    应用领域及检测意义：

l 单基因遗传病：单基因病（孟德尔遗传病）的辅助诊断

l 复杂性疾病：涉及多个系统的复杂疾病辅助诊断

l 家系/群体分析：通过大量病例关联分析，寻找新基因或已知基因的新突变

    数据分析

信息分析从测序的下机数据（raw data）开始，原始下机数据过滤掉接头、低质量碱基、未测出的碱基（以N 表示）后比对到参考基因组上，进行SNP检测和InDel或者CNV分析，然后通过数据库注释，对变异检测的结果通过基于变异有害性、样本情况和基因功能表型三种分析策略，筛选出于疾病相关的有害性位点或基因。另外, 为了保证高质量的测序数据，在整个分析流程中设置了严格的数据质控体系（QC）。

    样本类型

高纯度DNA仅需50ng，全血仅需50ul，同时，来自羊水、流产物、干血片的DNA均可得到和正常样本均一性和覆盖度相差无几的测序结果。

    适宜人群

1. 所有单基因遗传病疑似患者

2. 临床危重病症，预后判断困难，需要明确诊断并选择精准治疗方案的患者

3. 临床表型异质性强，病因复杂，常规诊断困难的多系统复杂疾病及综合征患者

4. 已用系统panel检测，但仍未确诊的家族遗传病患者

5. 家庭已有明确致病基因遗传病息者，拟生育第二胎进行遗传咨询的患者及其亲属